基龍米克斯生物科技

 

RNA產品項目	是否需 參考序列	建議物種	定序平台	建議規格	說明
De novo Transcriptome	N	全物種	Illumina NovaSeq	150 PE ≥ 6 Gb output	Transcript de-novo Assembly、基因表現量分析、基因差異表現、基因功能的差異表現
Genome-guide Transcriptome	Y	需有完整性高的參考序列	Illumina NovaSeq	150 PE  ≥ 6 Gb output	Genome-guide Transcript Assembly、基因表現量分析、基因差異表現、基因功能的差異表現 (需有 chromosome 等級以上 reference genome 及基因註解尤佳)
Iso-Seq	N	真核生物	PacBio Sequel I / Sequel II	≥ 30 Gb	Full-length transcript / isoform survey and discovery
Differential Gene Expression (DGE)	Y	模式生物	Illumina NovaSeq	150 PE ≥ 20 M reads	基因表現量分析、基因差異表現、基因功能的差異表現
Long non-coding RNA (LncRNA)	Y	模式生物	Illumina NovaSeq	150 PE ≥ 6 Gb output	Novel lncRNA identification、lncRNA expression profile、function of lncRNA
Small RNA	N*	模式生物*	Illumina NextSeq	75 SE ≥ 10 M reads	Novel miRNA identification、miRNA expression profile、differentially expressed miRNAs
The species database of small RNA should be searched at miRbase (http://www.mirbase.org/cgi-bin/browse.pl)

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