RNA定序服務

 

RNA產品項目 是否需
參考序列
建議物種 定序平台 建議規格 說明
De novo Transcriptome N 全物種 Illumina
NovaSeq
150 PE
≥ 6 Gb output
Transcript de-novo Assembly、基因表現量分析、基因差異表現、基因功能的差異表現
Genome-guide Transcriptome Y 需有完整性高的參考序列 Illumina
NovaSeq
150 PE 
≥ 6 Gb output
Genome-guide Transcript Assembly、基因表現量分析、基因差異表現、基因功能的差異表現
(需有 chromosome 等級以上 reference genome 及基因註解尤佳)
Iso-Seq N 真核生物 PacBio
Sequel I / Sequel II
≥ 30 Gb Full-length transcript / isoform survey and discovery
Differential Gene Expression (DGE) Y 模式生物 Illumina
NovaSeq
150 PE
≥ 20 M reads
基因表現量分析、基因差異表現、基因功能的差異表現
Long non-coding RNA (LncRNA) Y 模式生物 Illumina
NovaSeq
150 PE
≥ 6 Gb output
Novel lncRNA identification、lncRNA expression profile、function of lncRNA
Small RNA N* 模式生物* Illumina
NextSeq
75 SE
≥ 10 M reads
Novel miRNA identification、miRNA expression profile、differentially expressed miRNAs
The species database of small RNA should be searched at miRbase (http://www.mirbase.org/cgi-bin/browse.pl)

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