Template DNA有突變狀況（SNP、insertion、deletion）
狀況描述
- 序列中出現單一鹼基有雙重訊號。
- 所有波峰都很乾淨，卻在某個地方出現兩個重疊波峰。
發生的可能原因
- PCR DNA發生突變。
- 在做cloning時，DNA發生突變，特別是plasmid construct對細菌有毒性。
解決方式
- 假如template DNA是heterozygous時，將PCR產物先接合到vector上再定序。
- 假設plasmid construct對細菌有毒性，試著換個low copy number的vector，或改用其他strain的勝任細胞。
- 用另外一端primer定序。